WormLabは、C.エレガンスやその他の線虫の行動の画像収録、追跡、解析をするためのソフトウェアです 。
操作性の優れたユーザーインターフェイスと独自の線虫追跡、解析のアルゴリズムを備えており、単一または複数の線虫に関して、オメガベンド、反転、絡み合い等を含むデータを収集します。
ソフトウェアは、avi、wmv、mp4など、ほとんどのビデオファイル形式の解析ができます。

ビデオファイルからの複数の線虫の追跡

選択した線虫、またはフレーム内のすべての線虫を追跡

特許取得済みの識別アルゴリズムを使用して、単一または複数の線虫の以下の行動を区別
・EntanglementsとOmega bends　　
・ReversalsとPirouettes
・CoilingとSelf-overlap　　
・SwimmingとThrashing

高倍率、中倍率、または低倍率で追跡可能

伸長を含む蠕動進行運動を伴う高度な線虫モデル構築

複数の仮説の追跡により、線虫の追跡結果を改善

曲度と運動方向の両方を使用して頭と尾を区別

線虫の輪郭、中心点、軌跡、および頭/尾のマーカーの選択的な表示

解析結果をMicrosoft Excelにエクスポート可能

組み込みのワークフローは、WormLabシステムまたは、その他の画像取得システムからの画像データを取得、追跡、解析をするための各ステップを完全にカイド

ハードディスク等からの画像ファイルの読み込み、またはオプションのカメラ制御機能を使用してWormLabに接続されたカメラのライブ画像の読み込み

さまざまなビデオコーデックをサポート

WormLabは、追跡データをマルチタブテーブル形式で表示します。フレームごとの詳細データは、追跡された線虫ごとに提供され、要約データも出力されます。データを簡単にカスタマイズしてExcelまたはMatlabにエクスポートしたり、独自の解析を作成することもできます。解析出力には次のものが含まれます。

フレームごとのヘッド、ミッドポイント、テールの位置

センターライン上のポイント

速度

ボディエリア

振幅

距離

方向

体の曲げ角度

ヘッドの曲げ角度

オメガベンド検出

反転検出

WormLab Imaging System